有效期不同。
核酸48小时和24小时最主要的区别就是有效期不同，其中24小时核酸检测是指在24小时内有效，即只能在当天使用；而48小时核酸是48小时内有效。
但是不管是24小时还是48小时核酸检测，有效期内的核酸检测结果都只是提供参考，因为核酸检测也会存在假阳性和假阴性的情况，具体需要根据实际情况和行动轨迹判定。
建议最好是提前一天做。
根据疫情有关规定，流动的人员会需要持有48小时核酸检测阴性证明才能通行，但是做核酸检测结果的出具又需要花费时间，因为核酸检测采样、检测等等程序都比较繁琐，出结果也还需要等待6~12小时的时间。
所以为了能在通行时拿到48小时核酸检测结果，需要提前去做核酸检测，建议最好是提前一天做，因为核酸48小时做太早可能会有过期的风险，比如如果是提前两天做的话，坐长途火车就有可能会在下车前过期；但是做太晚有可能会来不及拿到结果。
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